自己解決

自己解決しました。
新しいページを開く*1設定にしているときでも、personal bar*2上においたbookmarkやmenuからたどれるbookmarkは、Ctrl-Clickで新しいタブを開かずに移動することができます。これ使えば、ふつうにbookmarkletを動作させることが可能と。まぁ、そんなところ。side barに出てくるbookmarkのリストは、Ctrl-Clickで複数選択してしまうのでダメ。
にしてもこんな使うか使わないかぎりぎりの線の機能を用意しているあたりステキです。

*1:ページってかタブですね

*2:toolbarの位置にbookmarkをぺたぺた貼り付けられる